Lista de Problemas sobre Grandes Moléculas
Problema 11: Seqüência de um polipeptídeo
Tutorial para ajudar a resolver a questão
Um polipeptídeo com 5 aminoácidos foi dividido
em vários fragmentos menores e a seqüência de alguns
dos fragmentos foi determinada. Os fragmentos identificados incluem his-gly-ser,
ala-his, e ala-ala. Qual a seqüência primária
do polipeptídeo?
Tutorial
Aminoácidos em um polipeptídeo
| Os aminoácidos em um polipeptídeo estão ligados
como os elos de uma corrente. Um polipeptídeo com 5 aminoácidos
é análogo a uma corrente com 5 elos. Ele possui dois aminoácidos
terminais e três internos. Fragmentar a cadeia do polipeptídeo
é equivalente a quebrar uma corrente em correntes menores. Os aminoácidos
que são adjacentes nos fragmentos menores também eram adjacentes
na cadeia polipeptídica. |
Composição em aminoácidos
Um bom ponto de partida em problemas como esse é tentar determinar
a composição em aminoácidos do polipeptídeo.
Quais são os cinco aminoácidos que se combinam para formar
o peptídeo? Examinando a seqüência dos três fragmentos,
pode-se ver que:
Um fragmento tem a seqüência his-gly-ser,
e portanto estes três aminoácidos estão presentes.
Outro fragmento tem a seqüência ala-ala, o que indica
a presença de 2 alaninas.
Com apenas estes dois fragmentos, é possível determinar sem
ambigüidade a composição em aminoácidos do polipeptídeo
como sendo (his-gly-ser e ala-ala). Note que as outras combinações
de dois fragmentos (ala-ala e ala-his ou ala-his e
his-gly-ser) seriam suficientes para definir apenas 3 ou 4 dos 5
aminoácidos. |
Superpondo os fragmentos
| A partir dos dois fragmentos usados para determinar a composição
em aminoácidos, você também pode deduzir que a seqüência
deve ser his-gly-ser-ala-ala ou ala-ala-his-gly-ser.
A superposição do fragmento ala-his pode ser usada
para escolher entre essas duas possibilidades. |
 |
| A seqüência final do polipeptídeo com 5 aminoácidos
é ala-ala-his-gly-ser. |
  
   
O
Projeto Biológico
University of Arizona
Quarta-feira, 5 de janeiro de 2000
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